El presente trabajo de investigación, se realiza en la Institución Educativa de los Llanos de Cuivá, en el grado sexto, teniendo como objetivo analizar sí la incorporación de la WebQuest como herramienta didáctica en el proceso de enseñanza aprendizaje, influye significativamente en el rendimiento académico de los estudiantes, en el área de ciencias naturales y educación ambiental. Se diseña y aplica una WebQuest, sobre las causas y consecuencias de la contaminación del agua en los seres vivos, los contenidos cumplen los lineamientos dados por el Ministerio de Educación Nacional de Colombia, teniendo en cuenta los Derechos Básicos de Aprendizaje para este grado y área. La investigación es de tipo cuasi-experimental, con una metodología descriptiva y un enfoque cuantitativo. Dos grupos desarrollan la estrategia didáctica de la WebQuest y uno de manera tradicional (Grupo Control). Se aplican dos cuestionarios a cada grupo con preguntas abiertas, antes y después de implementar la estrategia de la WebQuest. Las técnicas estadísticas utilizadas corresponden a medidas de tendencia central (mediana y media) y comparación de grupos mediante la prueba t-student con un nivel de confianza del 95%. En la prueba Pretest los tres grupos obtuvieron valores en sus medidas de tendencia central menores a 2.0 en su rendimiento académico, demostrando un bajo desempeño en la competencia a trabajar. Las medidas de tendencia central en el Postest muestran que los grupos experimentales tienen mejores resultados en el rendimiento académico que el grupo que no trabajo la WebQuest. Al aplicar la prueba t-student en el Postest, evidencia que hay una diferencia significativa entre los grupos experimentales y el grupo control; y sin diferencia significativa entre los grupos experimentales con respecto al rendimiento académico. Teniendo como referencia los datos obtenidos, se concluye que, la estrategia didáctica de la WebQuest, dentro del aula de clase, influye significativamente en el rendimiento académico, de los estudiantes del grado sexto, en el área de ciencias naturales y educación ambiental.