Esta investigación ofrece un análisis comparativo de las políticas migratorias de Colombia y Panamá en el contexto del Tapón del Darién, utilizando un enfoque neoinstitucionalista. El estudio evalúa la efectividad de las políticas actuales, identifica vacíos y propone recomendaciones para mejorar la protección de los migrantes en tránsito. Se empleó una metodología cualitativa, que incluyó una revisión de legislación, informes de organizaciones internacionales y literatura académica seleccionada, con un enfoque en los aspectos más relevantes para el análisis. El enfoque principal fue entender cómo las instituciones formales e informales influyen en la gestión migratoria en la región del Darién. Los hallazgos indican que, aunque ambos países han ratificado acuerdos internacionales clave, existen disparidades en sus políticas y en su implementación. Colombia pone énfasis en la integración de los migrantes, pero enfrenta dificultades para implementar sus políticas. Panamá prioriza el control fronterizo, generando preocupaciones sobre los derechos humanos. Ambos países presentan deficiencias en la recopilación de datos y la coordinación institucional. La investigación concluye que es urgente establecer un marco de políticas binacionales que aborde las causas de la migración en tránsito y respete los derechos de los migrantes, destacando la necesidad de mejorar la cooperación regional y la recolección de datos.